1954年，一項針對名為「怪精」的神秘能源的實驗喚醒了哥斯拉以及大量不死的怪獸。在隨後的歲月里，人類幾乎不斷遭受怪獸襲擊的沉重打擊。雖然日本已經開始將怪獸視作自然災害——他們深知對抗哥斯拉只會讓威脅變本加厲——但美國的哥斯拉對策中心卻誓要戰鬥、戰鬥、再戰鬥。而美國人剛剛在對抗怪獸的戰鬥中發現了終極武器：一個擁有哥斯拉之力的少年，名叫傑森。他能夠像怪獸之王一樣駕馭神秘的怪精，而這個少年要麼拯救世界……要麼帶來毀滅。